Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRIP30626 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRIP30626 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRIP30626 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRIP30626 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRIP30626 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRIP30626 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRIP30626 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRIP30626 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRIP30626 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRIP30626 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRIP30626 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRIP30626 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRIP30626 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRIP30626 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRIP30626 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRIP30626 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRIP30626 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRIP30626 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRIP30626 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRIP30626 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRIP30626 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRIP30626 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRIP30626 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRIP30626 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRIP30626 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRIP30626 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRIP30626 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRIP30626 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRIP30626 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRIP30626 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRIP30626 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRIP30626 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRIP30626 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRIP30626 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRIP30626 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRIP30626 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRIP30626 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRIP30626 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRIP30626 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRIP30626 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRIP30626 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRIP30626 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRIP30626 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRIP30626 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRIP30626 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms