Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA2P29317 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA2P29317 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA2P29317 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA2P29317 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA2P29317 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA2P29317 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA2P29317 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA2P29317 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms