Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1BP29016 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1BP29016 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD1BP29016 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1BP29016 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1BP29016 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD1BP29016 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD1BP29016 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1BP29016 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD1BP29016 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1BP29016 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1BP29016 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD1BP29016 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD1BP29016 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD1BP29016 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1BP29016 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1BP29016 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD1BP29016 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1BP29016 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1BP29016 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1BP29016 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD1BP29016 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD1BP29016 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CD1BP29016 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1BP29016 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1BP29016 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD1BP29016 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD1BP29016 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD1BP29016 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD1BP29016 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD1BP29016 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD1BP29016 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD1BP29016 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD1BP29016 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD1BP29016 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD1BP29016 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD1BP29016 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD1BP29016 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD1BP29016 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD1BP29016 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD1BP29016 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD1BP29016 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD1BP29016 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD1BP29016 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD1BP29016 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD1BP29016 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD1BP29016 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD1BP29016 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD1BP29016 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD1BP29016 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD1BP29016 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD1BP29016 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD1BP29016 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD1BP29016 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD1BP29016 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD1BP29016 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD1BP29016 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD1BP29016 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD1BP29016 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD1BP29016 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD1BP29016 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD1BP29016 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD1BP29016 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD1BP29016 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD1BP29016 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD1BP29016 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD1BP29016 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD1BP29016 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD1BP29016 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD1BP29016 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CD1BP29016 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD1BP29016 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD1BP29016 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD1BP29016 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD1BP29016 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD1BP29016 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD1BP29016 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD1BP29016 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD1BP29016 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD1BP29016 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD1BP29016 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD1BP29016 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD1BP29016 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD1BP29016 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD1BP29016 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD1BP29016 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD1BP29016 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD1BP29016 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD1BP29016 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms