Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRM1P23921 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRM1P23921 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRM1P23921 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRM1P23921 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRM1P23921 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRM1P23921 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRM1P23921 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRM1P23921 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRM1P23921 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRM1P23921 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRM1P23921 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRM1P23921 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRM1P23921 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRM1P23921 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRM1P23921 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRM1P23921 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRM1P23921 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRM1P23921 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRM1P23921 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRM1P23921 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRM1P23921 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRM1P23921 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRM1P23921 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRM1P23921 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRM1P23921 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRM1P23921 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRM1P23921 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRM1P23921 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRM1P23921 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRM1P23921 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRM1P23921 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRM1P23921 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRM1P23921 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRM1P23921 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRM1P23921 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRM1P23921 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
RRM1P23921 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRM1P23921 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRM1P23921 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRM1P23921 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRM1P23921 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRM1P23921 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRM1P23921 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRM1P23921 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRM1P23921 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRM1P23921 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRM1P23921 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRM1P23921 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRM1P23921 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRM1P23921 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRM1P23921 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRM1P23921 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRM1P23921 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRM1P23921 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRM1P23921 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRM1P23921 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRM1P23921 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRM1P23921 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRM1P23921 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRM1P23921 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRM1P23921 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRM1P23921 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRM1P23921 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRM1P23921 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRM1P23921 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRM1P23921 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRM1P23921 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRM1P23921 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRM1P23921 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRM1P23921 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRM1P23921 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRM1P23921 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRM1P23921 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRM1P23921 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRM1P23921 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRM1P23921 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRM1P23921 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRM1P23921 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRM1P23921 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRM1P23921 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRM1P23921 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRM1P23921 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRM1P23921 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRM1P23921 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRM1P23921 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRM1P23921 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RRM1P23921 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRM1P23921 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRM1P23921 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRM1P23921 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRM1P23921 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRM1P23921 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRM1P23921 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRM1P23921 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms