Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAX3P23760 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAX3P23760 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAX3P23760 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PAX3P23760 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PAX3P23760 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PAX3P23760 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAX3P23760 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAX3P23760 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAX3P23760 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAX3P23760 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAX3P23760 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAX3P23760 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PAX3P23760 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAX3P23760 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAX3P23760 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAX3P23760 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAX3P23760 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAX3P23760 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX3P23760 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX3P23760 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX3P23760 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX3P23760 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PAX3P23760 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAX3P23760 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PAX3P23760 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAX3P23760 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAX3P23760 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PAX3P23760 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAX3P23760 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAX3P23760 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAX3P23760 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAX3P23760 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAX3P23760 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAX3P23760 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAX3P23760 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAX3P23760 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAX3P23760 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAX3P23760 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAX3P23760 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAX3P23760 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PAX3P23760 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAX3P23760 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAX3P23760 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PAX3P23760 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAX3P23760 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAX3P23760 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX3P23760 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX3P23760 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX3P23760 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX3P23760 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX3P23760 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAX3P23760 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAX3P23760 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAX3P23760 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAX3P23760 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAX3P23760 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAX3P23760 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAX3P23760 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAX3P23760 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAX3P23760 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAX3P23760 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAX3P23760 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAX3P23760 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAX3P23760 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PAX3P23760 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAX3P23760 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAX3P23760 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAX3P23760 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAX3P23760 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAX3P23760 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAX3P23760 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAX3P23760 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAX3P23760 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAX3P23760 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAX3P23760 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAX3P23760 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAX3P23760 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAX3P23760 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAX3P23760 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAX3P23760 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAX3P23760 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAX3P23760 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAX3P23760 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAX3P23760 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAX3P23760 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAX3P23760 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAX3P23760 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAX3P23760 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAX3P23760 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAX3P23760 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAX3P23760 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAX3P23760 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAX3P23760 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAX3P23760 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAX3P23760 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAX3P23760 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAX3P23760 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAX3P23760 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAX3P23760 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms