Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MCCP23508 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MCCP23508 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MCCP23508 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MCCP23508 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MCCP23508 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MCCP23508 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MCCP23508 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MCCP23508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MCCP23508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MCCP23508 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MCCP23508 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MCCP23508 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MCCP23508 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MCCP23508 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MCCP23508 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MCCP23508 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MCCP23508 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MCCP23508 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MCCP23508 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
MCCP23508 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MCCP23508 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MCCP23508 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MCCP23508 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MCCP23508 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MCCP23508 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MCCP23508 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
MCCP23508 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MCCP23508 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MCCP23508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MCCP23508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MCCP23508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MCCP23508 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MCCP23508 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MCCP23508 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
MCCP23508 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MCCP23508 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MCCP23508 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MCCP23508 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MCCP23508 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
MCCP23508 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MCCP23508 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MCCP23508 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MCCP23508 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MCCP23508 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MCCP23508 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCCP23508 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCCP23508 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCCP23508 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCCP23508 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCCP23508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MCCP23508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCCP23508 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCCP23508 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCCP23508 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCCP23508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
MCCP23508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MCCP23508 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MCCP23508 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MCCP23508 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MCCP23508 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCCP23508 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCCP23508 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCCP23508 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MCCP23508 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCCP23508 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCCP23508 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MCCP23508 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCCP23508 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MCCP23508 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCCP23508 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCCP23508 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
MCCP23508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCCP23508 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCCP23508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCCP23508 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCCP23508 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCCP23508 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MCCP23508 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MCCP23508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MCCP23508 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCCP23508 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCCP23508 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
MCCP23508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCCP23508 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MCCP23508 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCCP23508 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCCP23508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MCCP23508 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCCP23508 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCCP23508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCCP23508 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCCP23508 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCCP23508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms