Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRR1BP22528 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR1BP22528 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR1BP22528 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR1BP22528 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1BP22528 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms