Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCF2P19878 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCF2P19878 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCF2P19878 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCF2P19878 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCF2P19878 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCF2P19878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCF2P19878 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCF2P19878 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCF2P19878 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCF2P19878 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCF2P19878 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCF2P19878 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCF2P19878 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCF2P19878 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF2P19878 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF2P19878 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF2P19878 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCF2P19878 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCF2P19878 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCF2P19878 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCF2P19878 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCF2P19878 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCF2P19878 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCF2P19878 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCF2P19878 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCF2P19878 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCF2P19878 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCF2P19878 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCF2P19878 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF2P19878 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF2P19878 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF2P19878 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF2P19878 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF2P19878 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF2P19878 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCF2P19878 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCF2P19878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCF2P19878 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF2P19878 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF2P19878 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCF2P19878 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCF2P19878 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCF2P19878 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCF2P19878 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCF2P19878 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF2P19878 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF2P19878 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF2P19878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCF2P19878 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCF2P19878 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCF2P19878 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCF2P19878 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCF2P19878 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCF2P19878 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCF2P19878 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCF2P19878 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCF2P19878 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCF2P19878 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCF2P19878 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCF2P19878 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF2P19878 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF2P19878 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF2P19878 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF2P19878 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCF2P19878 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCF2P19878 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCF2P19878 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCF2P19878 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCF2P19878 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCF2P19878 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCF2P19878 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCF2P19878 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCF2P19878 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NCF2P19878 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCF2P19878 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCF2P19878 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCF2P19878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCF2P19878 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCF2P19878 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCF2P19878 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCF2P19878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF2P19878 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF2P19878 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF2P19878 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCF2P19878 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCF2P19878 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCF2P19878 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCF2P19878 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCF2P19878 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCF2P19878 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCF2P19878 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCF2P19878 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCF2P19878 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCF2P19878 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCF2P19878 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCF2P19878 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCF2P19878 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCF2P19878 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCF2P19878 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms