Protein–RNA interactions for Protein: P17568

NDUFB7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB7P17568 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB7P17568 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB7P17568 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB7P17568 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB7P17568 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFB7P17568 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFB7P17568 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB7P17568 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB7P17568 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms