Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB4P17483 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB4P17483 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB4P17483 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB4P17483 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB4P17483 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB4P17483 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB4P17483 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB4P17483 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms