Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC1P15941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC1P15941 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC1P15941 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC1P15941 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC1P15941 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC1P15941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC1P15941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MUC1P15941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC1P15941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MUC1P15941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MUC1P15941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC1P15941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MUC1P15941 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC1P15941 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC1P15941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC1P15941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MUC1P15941 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC1P15941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MUC1P15941 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC1P15941 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MUC1P15941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC1P15941 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MUC1P15941 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC1P15941 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC1P15941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC1P15941 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MUC1P15941 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC1P15941 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MUC1P15941 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MUC1P15941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC1P15941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC1P15941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC1P15941 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC1P15941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC1P15941 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC1P15941 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC1P15941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC1P15941 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC1P15941 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC1P15941 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC1P15941 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MUC1P15941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC1P15941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC1P15941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC1P15941 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC1P15941 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC1P15941 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC1P15941 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC1P15941 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC1P15941 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC1P15941 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC1P15941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC1P15941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC1P15941 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC1P15941 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC1P15941 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC1P15941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC1P15941 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC1P15941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC1P15941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC1P15941 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC1P15941 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC1P15941 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC1P15941 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC1P15941 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC1P15941 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC1P15941 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC1P15941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC1P15941 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC1P15941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC1P15941 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC1P15941 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC1P15941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC1P15941 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC1P15941 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MUC1P15941 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC1P15941 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC1P15941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC1P15941 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC1P15941 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC1P15941 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC1P15941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC1P15941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC1P15941 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC1P15941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC1P15941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC1P15941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC1P15941 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC1P15941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC1P15941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC1P15941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC1P15941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC1P15941 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC1P15941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC1P15941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC1P15941 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC1P15941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC1P15941 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC1P15941 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms