Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC5A1P13866 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC5A1P13866 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC5A1P13866 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC5A1P13866 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC5A1P13866 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC5A1P13866 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLC5A1P13866 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SLC5A1P13866 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLC5A1P13866 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLC5A1P13866 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC5A1P13866 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms