Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEACAM1P13688 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEACAM1P13688 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CEACAM1P13688 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CEACAM1P13688 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEACAM1P13688 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEACAM1P13688 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEACAM1P13688 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEACAM1P13688 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEACAM1P13688 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEACAM1P13688 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms