Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
LAMC1P11047 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LAMC1P11047 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
LAMC1P11047 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LAMC1P11047 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
LAMC1P11047 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
LAMC1P11047 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
LAMC1P11047 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
LAMC1P11047 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
LAMC1P11047 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
LAMC1P11047 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms