Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCBP10092 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCBP10092 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCBP10092 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCBP10092 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCBP10092 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCBP10092 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCBP10092 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCBP10092 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCBP10092 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCBP10092 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCBP10092 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCBP10092 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCBP10092 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCBP10092 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCBP10092 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCBP10092 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCBP10092 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCBP10092 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCBP10092 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCBP10092 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCBP10092 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCBP10092 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCBP10092 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCBP10092 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCBP10092 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCBP10092 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCBP10092 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCBP10092 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCBP10092 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCBP10092 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCBP10092 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCBP10092 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCBP10092 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCBP10092 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCBP10092 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCBP10092 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCBP10092 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCBP10092 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CALCBP10092 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCBP10092 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCBP10092 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALCBP10092 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCBP10092 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCBP10092 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCBP10092 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCBP10092 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCBP10092 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALCBP10092 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CALCBP10092 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CALCBP10092 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCBP10092 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCBP10092 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCBP10092 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCBP10092 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCBP10092 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCBP10092 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCBP10092 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCBP10092 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCBP10092 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCBP10092 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCBP10092 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCBP10092 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCBP10092 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCBP10092 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCBP10092 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCBP10092 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCBP10092 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCBP10092 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALCBP10092 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCBP10092 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCBP10092 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCBP10092 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCBP10092 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCBP10092 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCBP10092 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCBP10092 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCBP10092 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCBP10092 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCBP10092 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCBP10092 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCBP10092 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCBP10092 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCBP10092 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCBP10092 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCBP10092 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCBP10092 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCBP10092 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCBP10092 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCBP10092 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCBP10092 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCBP10092 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCBP10092 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCBP10092 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALCBP10092 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms