Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-13P0DP09 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-13P0DP09 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-13P0DP09 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-13P0DP09 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-13P0DP09 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1-13P0DP09 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-13P0DP09 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms