Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN8OSP0DMR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN8OSP0DMR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN8OSP0DMR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN8OSP0DMR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN8OSP0DMR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN8OSP0DMR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN8OSP0DMR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms