Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM49P0CI25 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM49P0CI25 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM49P0CI25 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM49P0CI25 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM49P0CI25 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM49P0CI25 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM49P0CI25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM49P0CI25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM49P0CI25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms