Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MMP10P09238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MMP10P09238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MMP10P09238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MMP10P09238 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MMP10P09238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MMP10P09238 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MMP10P09238 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MMP10P09238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MMP10P09238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MMP10P09238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MMP10P09238 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MMP10P09238 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MMP10P09238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MMP10P09238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MMP10P09238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MMP10P09238 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MMP10P09238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MMP10P09238 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MMP10P09238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MMP10P09238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
MMP10P09238 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MMP10P09238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
MMP10P09238 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
MMP10P09238 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MMP10P09238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MMP10P09238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
MMP10P09238 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MMP10P09238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MMP10P09238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MMP10P09238 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MMP10P09238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MMP10P09238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MMP10P09238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MMP10P09238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MMP10P09238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MMP10P09238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
MMP10P09238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MMP10P09238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MMP10P09238 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MMP10P09238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MMP10P09238 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MMP10P09238 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MMP10P09238 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MMP10P09238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
MMP10P09238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MMP10P09238 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MMP10P09238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MMP10P09238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MMP10P09238 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MMP10P09238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MMP10P09238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MMP10P09238 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MMP10P09238 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
MMP10P09238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MMP10P09238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MMP10P09238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MMP10P09238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MMP10P09238 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
MMP10P09238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MMP10P09238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MMP10P09238 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MMP10P09238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MMP10P09238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MMP10P09238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MMP10P09238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MMP10P09238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MMP10P09238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MMP10P09238 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
MMP10P09238 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MMP10P09238 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MMP10P09238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MMP10P09238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MMP10P09238 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MMP10P09238 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MMP10P09238 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MMP10P09238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MMP10P09238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MMP10P09238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MMP10P09238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MMP10P09238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
MMP10P09238 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MMP10P09238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MMP10P09238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MMP10P09238 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MMP10P09238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MMP10P09238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MMP10P09238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MMP10P09238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MMP10P09238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MMP10P09238 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MMP10P09238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MMP10P09238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
MMP10P09238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MMP10P09238 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms