Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV4-1P06312 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV4-1P06312 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGKV4-1P06312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV4-1P06312 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV4-1P06312 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV4-1P06312 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms