Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGF1P05230 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGF1P05230 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FGF1P05230 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGF1P05230 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGF1P05230 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGF1P05230 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGF1P05230 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGF1P05230 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGF1P05230 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGF1P05230 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGF1P05230 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGF1P05230 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGF1P05230 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGF1P05230 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGF1P05230 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGF1P05230 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGF1P05230 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGF1P05230 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGF1P05230 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGF1P05230 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGF1P05230 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGF1P05230 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGF1P05230 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGF1P05230 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGF1P05230 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGF1P05230 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGF1P05230 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGF1P05230 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGF1P05230 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FGF1P05230 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGF1P05230 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGF1P05230 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGF1P05230 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGF1P05230 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGF1P05230 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGF1P05230 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGF1P05230 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGF1P05230 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGF1P05230 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGF1P05230 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGF1P05230 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGF1P05230 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGF1P05230 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGF1P05230 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGF1P05230 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGF1P05230 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGF1P05230 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGF1P05230 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FGF1P05230 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGF1P05230 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGF1P05230 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGF1P05230 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGF1P05230 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGF1P05230 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGF1P05230 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGF1P05230 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGF1P05230 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGF1P05230 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGF1P05230 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGF1P05230 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGF1P05230 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGF1P05230 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGF1P05230 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGF1P05230 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGF1P05230 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGF1P05230 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGF1P05230 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGF1P05230 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGF1P05230 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGF1P05230 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGF1P05230 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FGF1P05230 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGF1P05230 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGF1P05230 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGF1P05230 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGF1P05230 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGF1P05230 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGF1P05230 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGF1P05230 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGF1P05230 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGF1P05230 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGF1P05230 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGF1P05230 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGF1P05230 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGF1P05230 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGF1P05230 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGF1P05230 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGF1P05230 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGF1P05230 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGF1P05230 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGF1P05230 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGF1P05230 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGF1P05230 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGF1P05230 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms