Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGN1P05114 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN1P05114 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN1P05114 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN1P05114 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGN1P05114 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGN1P05114 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN1P05114 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms