Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPSP04118 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPSP04118 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPSP04118 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPSP04118 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPSP04118 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPSP04118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPSP04118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPSP04118 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPSP04118 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPSP04118 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPSP04118 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPSP04118 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPSP04118 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPSP04118 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPSP04118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPSP04118 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPSP04118 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPSP04118 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPSP04118 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPSP04118 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPSP04118 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPSP04118 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPSP04118 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPSP04118 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPSP04118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPSP04118 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPSP04118 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPSP04118 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPSP04118 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPSP04118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPSP04118 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPSP04118 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPSP04118 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPSP04118 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPSP04118 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLPSP04118 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPSP04118 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPSP04118 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPSP04118 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPSP04118 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLPSP04118 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPSP04118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPSP04118 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPSP04118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPSP04118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPSP04118 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPSP04118 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPSP04118 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPSP04118 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPSP04118 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPSP04118 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPSP04118 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPSP04118 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPSP04118 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLPSP04118 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPSP04118 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPSP04118 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPSP04118 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPSP04118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPSP04118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPSP04118 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPSP04118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPSP04118 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPSP04118 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPSP04118 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPSP04118 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPSP04118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPSP04118 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPSP04118 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPSP04118 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPSP04118 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPSP04118 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPSP04118 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPSP04118 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPSP04118 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPSP04118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPSP04118 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPSP04118 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPSP04118 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPSP04118 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPSP04118 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPSP04118 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPSP04118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPSP04118 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPSP04118 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLPSP04118 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLPSP04118 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPSP04118 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPSP04118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPSP04118 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLPSP04118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPSP04118 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPSP04118 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLPSP04118 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 391.2 ms