Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOA1P02647 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA1P02647 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOA1P02647 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA1P02647 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA1P02647 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA1P02647 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA1P02647 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA1P02647 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA1P02647 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA1P02647 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA1P02647 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA1P02647 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA1P02647 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA1P02647 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA1P02647 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA1P02647 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA1P02647 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA1P02647 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA1P02647 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA1P02647 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA1P02647 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA1P02647 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOA1P02647 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA1P02647 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOA1P02647 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA1P02647 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOA1P02647 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOA1P02647 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA1P02647 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOA1P02647 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA1P02647 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOA1P02647 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA1P02647 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA1P02647 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA1P02647 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOA1P02647 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA1P02647 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA1P02647 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOA1P02647 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA1P02647 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA1P02647 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOA1P02647 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA1P02647 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA1P02647 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA1P02647 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA1P02647 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA1P02647 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA1P02647 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA1P02647 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA1P02647 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA1P02647 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA1P02647 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA1P02647 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA1P02647 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA1P02647 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA1P02647 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA1P02647 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA1P02647 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA1P02647 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA1P02647 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA1P02647 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA1P02647 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA1P02647 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA1P02647 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA1P02647 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA1P02647 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA1P02647 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA1P02647 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA1P02647 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA1P02647 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA1P02647 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA1P02647 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA1P02647 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA1P02647 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA1P02647 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA1P02647 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA1P02647 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA1P02647 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA1P02647 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA1P02647 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA1P02647 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA1P02647 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA1P02647 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA1P02647 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA1P02647 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA1P02647 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA1P02647 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOA1P02647 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA1P02647 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOA1P02647 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOA1P02647 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOA1P02647 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA1P02647 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOA1P02647 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms