Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB1P01137 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB1P01137 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGFB1P01137 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB1P01137 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB1P01137 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TGFB1P01137 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFB1P01137 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB1P01137 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB1P01137 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB1P01137 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB1P01137 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB1P01137 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB1P01137 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms