Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CST3P01034 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CST3P01034 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CST3P01034 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CST3P01034 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CST3P01034 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CST3P01034 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CST3P01034 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CST3P01034 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CST3P01034 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CST3P01034 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CST3P01034 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CST3P01034 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CST3P01034 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CST3P01034 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CST3P01034 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CST3P01034 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CST3P01034 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CST3P01034 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CST3P01034 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CST3P01034 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CST3P01034 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CST3P01034 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CST3P01034 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CST3P01034 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CST3P01034 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CST3P01034 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CST3P01034 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CST3P01034 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CST3P01034 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CST3P01034 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CST3P01034 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CST3P01034 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CST3P01034 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CST3P01034 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CST3P01034 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CST3P01034 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CST3P01034 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CST3P01034 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CST3P01034 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CST3P01034 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CST3P01034 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CST3P01034 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CST3P01034 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CST3P01034 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST3P01034 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST3P01034 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST3P01034 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST3P01034 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CST3P01034 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CST3P01034 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CST3P01034 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CST3P01034 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CST3P01034 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CST3P01034 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CST3P01034 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CST3P01034 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CST3P01034 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CST3P01034 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CST3P01034 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CST3P01034 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CST3P01034 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CST3P01034 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CST3P01034 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CST3P01034 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CST3P01034 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CST3P01034 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CST3P01034 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CST3P01034 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CST3P01034 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CST3P01034 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CST3P01034 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CST3P01034 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CST3P01034 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CST3P01034 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CST3P01034 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CST3P01034 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CST3P01034 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CST3P01034 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CST3P01034 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CST3P01034 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CST3P01034 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CST3P01034 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CST3P01034 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CST3P01034 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CST3P01034 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CST3P01034 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CST3P01034 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CST3P01034 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CST3P01034 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CST3P01034 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CST3P01034 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CST3P01034 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CST3P01034 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CST3P01034 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CST3P01034 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CST3P01034 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CST3P01034 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CST3P01034 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CST3P01034 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms