Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTL6AO96019 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTL6AO96019 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTL6AO96019 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTL6AO96019 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTL6AO96019 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTL6AO96019 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTL6AO96019 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTL6AO96019 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms