Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL1O95922 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL1O95922 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL1O95922 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TTLL1O95922 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTLL1O95922 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTLL1O95922 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TTLL1O95922 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TTLL1O95922 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTLL1O95922 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTLL1O95922 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TTLL1O95922 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTLL1O95922 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms