Protein–RNA interactions for Protein: O95755

RAB36, Ras-related protein Rab-36, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB36O95755 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB36O95755 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB36O95755 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB36O95755 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB36O95755 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB36O95755 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB36O95755 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB36O95755 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB36O95755 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB36O95755 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB36O95755 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB36O95755 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB36O95755 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB36O95755 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB36O95755 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB36O95755 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB36O95755 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB36O95755 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB36O95755 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB36O95755 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB36O95755 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB36O95755 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB36O95755 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB36O95755 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB36O95755 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB36O95755 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB36O95755 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB36O95755 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB36O95755 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB36O95755 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB36O95755 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB36O95755 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB36O95755 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB36O95755 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB36O95755 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB36O95755 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB36O95755 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB36O95755 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB36O95755 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB36O95755 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB36O95755 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB36O95755 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB36O95755 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB36O95755 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB36O95755 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB36O95755 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB36O95755 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB36O95755 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB36O95755 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB36O95755 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB36O95755 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB36O95755 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB36O95755 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB36O95755 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB36O95755 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB36O95755 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB36O95755 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB36O95755 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB36O95755 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB36O95755 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB36O95755 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB36O95755 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB36O95755 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB36O95755 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB36O95755 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB36O95755 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB36O95755 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB36O95755 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB36O95755 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB36O95755 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB36O95755 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB36O95755 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB36O95755 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB36O95755 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB36O95755 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB36O95755 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB36O95755 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB36O95755 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB36O95755 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB36O95755 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB36O95755 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB36O95755 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB36O95755 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB36O95755 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB36O95755 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB36O95755 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB36O95755 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB36O95755 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB36O95755 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB36O95755 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB36O95755 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB36O95755 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB36O95755 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms