Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P2O95744 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P2O95744 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P2O95744 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS2P2O95744 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMS2P2O95744 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P2O95744 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P2O95744 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms