Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SEC24BO95487 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEC24BO95487 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SEC24BO95487 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SEC24BO95487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SEC24BO95487 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SEC24BO95487 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SEC24BO95487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SEC24BO95487 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SEC24BO95487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SEC24BO95487 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SEC24BO95487 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SEC24BO95487 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SEC24BO95487 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SEC24BO95487 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEC24BO95487 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SEC24BO95487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEC24BO95487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms