Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIC2O95409 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZIC2O95409 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC2O95409 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZIC2O95409 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZIC2O95409 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIC2O95409 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIC2O95409 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms