Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCELO95171 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCELO95171 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCELO95171 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCELO95171 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCELO95171 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCELO95171 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCELO95171 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCELO95171 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCELO95171 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCELO95171 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCELO95171 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCELO95171 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCELO95171 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCELO95171 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCELO95171 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCELO95171 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCELO95171 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCELO95171 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCELO95171 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCELO95171 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCELO95171 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCELO95171 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCELO95171 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCELO95171 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCELO95171 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCELO95171 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCELO95171 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCELO95171 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCELO95171 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCELO95171 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCELO95171 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCELO95171 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCELO95171 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCELO95171 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCELO95171 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCELO95171 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCELO95171 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCELO95171 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCELO95171 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCELO95171 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCELO95171 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCELO95171 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCELO95171 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCELO95171 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCELO95171 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCELO95171 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCELO95171 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCELO95171 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCELO95171 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCELO95171 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCELO95171 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCELO95171 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCELO95171 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCELO95171 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCELO95171 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCELO95171 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCELO95171 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCELO95171 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCELO95171 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCELO95171 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCELO95171 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCELO95171 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCELO95171 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCELO95171 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCELO95171 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCELO95171 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCELO95171 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCELO95171 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCELO95171 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCELO95171 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCELO95171 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCELO95171 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCELO95171 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCELO95171 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCELO95171 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCELO95171 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCELO95171 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCELO95171 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCELO95171 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCELO95171 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCELO95171 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCELO95171 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCELO95171 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCELO95171 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCELO95171 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCELO95171 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCELO95171 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCELO95171 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCELO95171 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCELO95171 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCELO95171 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCELO95171 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCELO95171 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms