Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DKK1O94907 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DKK1O94907 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DKK1O94907 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DKK1O94907 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DKK1O94907 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DKK1O94907 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DKK1O94907 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DKK1O94907 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DKK1O94907 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DKK1O94907 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DKK1O94907 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DKK1O94907 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DKK1O94907 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DKK1O94907 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DKK1O94907 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DKK1O94907 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DKK1O94907 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DKK1O94907 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DKK1O94907 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DKK1O94907 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK1O94907 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK1O94907 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DKK1O94907 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DKK1O94907 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DKK1O94907 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DKK1O94907 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK1O94907 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK1O94907 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK1O94907 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DKK1O94907 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK1O94907 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK1O94907 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK1O94907 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK1O94907 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DKK1O94907 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DKK1O94907 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK1O94907 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK1O94907 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK1O94907 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK1O94907 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK1O94907 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK1O94907 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DKK1O94907 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DKK1O94907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DKK1O94907 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DKK1O94907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DKK1O94907 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DKK1O94907 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DKK1O94907 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DKK1O94907 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DKK1O94907 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK1O94907 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK1O94907 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DKK1O94907 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DKK1O94907 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DKK1O94907 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DKK1O94907 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DKK1O94907 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK1O94907 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK1O94907 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK1O94907 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK1O94907 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK1O94907 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK1O94907 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DKK1O94907 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK1O94907 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK1O94907 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK1O94907 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK1O94907 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DKK1O94907 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DKK1O94907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DKK1O94907 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK1O94907 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK1O94907 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK1O94907 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK1O94907 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK1O94907 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK1O94907 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DKK1O94907 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DKK1O94907 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DKK1O94907 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK1O94907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DKK1O94907 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DKK1O94907 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DKK1O94907 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DKK1O94907 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DKK1O94907 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DKK1O94907 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DKK1O94907 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DKK1O94907 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DKK1O94907 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DKK1O94907 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DKK1O94907 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DKK1O94907 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms