Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
UFL1O94874 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UFL1O94874 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UFL1O94874 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UFL1O94874 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
UFL1O94874 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UFL1O94874 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UFL1O94874 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UFL1O94874 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UFL1O94874 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UFL1O94874 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UFL1O94874 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UFL1O94874 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
UFL1O94874 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UFL1O94874 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UFL1O94874 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UFL1O94874 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UFL1O94874 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UFL1O94874 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UFL1O94874 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UFL1O94874 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UFL1O94874 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
UFL1O94874 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UFL1O94874 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UFL1O94874 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UFL1O94874 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UFL1O94874 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UFL1O94874 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UFL1O94874 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UFL1O94874 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UFL1O94874 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UFL1O94874 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UFL1O94874 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UFL1O94874 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UFL1O94874 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
UFL1O94874 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
UFL1O94874 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UFL1O94874 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
UFL1O94874 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UFL1O94874 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UFL1O94874 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
UFL1O94874 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UFL1O94874 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UFL1O94874 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UFL1O94874 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UFL1O94874 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UFL1O94874 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UFL1O94874 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UFL1O94874 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
UFL1O94874 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UFL1O94874 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UFL1O94874 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UFL1O94874 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UFL1O94874 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UFL1O94874 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
UFL1O94874 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UFL1O94874 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UFL1O94874 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
UFL1O94874 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
UFL1O94874 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
UFL1O94874 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UFL1O94874 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
UFL1O94874 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
UFL1O94874 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UFL1O94874 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UFL1O94874 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
UFL1O94874 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UFL1O94874 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
UFL1O94874 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
UFL1O94874 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
UFL1O94874 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
UFL1O94874 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
UFL1O94874 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
UFL1O94874 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UFL1O94874 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UFL1O94874 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
UFL1O94874 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UFL1O94874 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UFL1O94874 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UFL1O94874 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UFL1O94874 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
UFL1O94874 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
UFL1O94874 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
UFL1O94874 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
UFL1O94874 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
UFL1O94874 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
UFL1O94874 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
UFL1O94874 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
UFL1O94874 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
UFL1O94874 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
UFL1O94874 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UFL1O94874 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
UFL1O94874 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UFL1O94874 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UFL1O94874 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UFL1O94874 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
UFL1O94874 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UFL1O94874 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UFL1O94874 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UFL1O94874 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms