Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ECM2O94769 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM2O94769 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ECM2O94769 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ECM2O94769 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ECM2O94769 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ECM2O94769 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ECM2O94769 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM2O94769 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ECM2O94769 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ECM2O94769 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ECM2O94769 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ECM2O94769 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ECM2O94769 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ECM2O94769 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ECM2O94769 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ECM2O94769 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ECM2O94769 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ECM2O94769 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ECM2O94769 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ECM2O94769 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ECM2O94769 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM2O94769 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ECM2O94769 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ECM2O94769 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ECM2O94769 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM2O94769 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM2O94769 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM2O94769 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM2O94769 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM2O94769 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ECM2O94769 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ECM2O94769 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ECM2O94769 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ECM2O94769 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ECM2O94769 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ECM2O94769 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ECM2O94769 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ECM2O94769 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM2O94769 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM2O94769 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM2O94769 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ECM2O94769 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ECM2O94769 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ECM2O94769 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ECM2O94769 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ECM2O94769 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM2O94769 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ECM2O94769 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ECM2O94769 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ECM2O94769 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ECM2O94769 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ECM2O94769 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ECM2O94769 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ECM2O94769 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM2O94769 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM2O94769 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM2O94769 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ECM2O94769 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ECM2O94769 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ECM2O94769 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ECM2O94769 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ECM2O94769 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ECM2O94769 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ECM2O94769 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ECM2O94769 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ECM2O94769 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ECM2O94769 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ECM2O94769 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ECM2O94769 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ECM2O94769 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ECM2O94769 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ECM2O94769 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ECM2O94769 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ECM2O94769 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM2O94769 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM2O94769 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM2O94769 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM2O94769 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM2O94769 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ECM2O94769 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ECM2O94769 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ECM2O94769 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ECM2O94769 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ECM2O94769 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ECM2O94769 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ECM2O94769 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ECM2O94769 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ECM2O94769 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM2O94769 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM2O94769 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ECM2O94769 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ECM2O94769 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ECM2O94769 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ECM2O94769 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ECM2O94769 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ECM2O94769 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ECM2O94769 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ECM2O94769 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ECM2O94769 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms