Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX3O75364 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX3O75364 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX3O75364 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX3O75364 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX3O75364 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX3O75364 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITX3O75364 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX3O75364 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX3O75364 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX3O75364 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX3O75364 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX3O75364 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX3O75364 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX3O75364 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX3O75364 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX3O75364 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX3O75364 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX3O75364 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX3O75364 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX3O75364 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX3O75364 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX3O75364 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX3O75364 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX3O75364 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX3O75364 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX3O75364 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX3O75364 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX3O75364 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX3O75364 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX3O75364 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX3O75364 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX3O75364 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX3O75364 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX3O75364 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX3O75364 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX3O75364 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX3O75364 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX3O75364 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PITX3O75364 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX3O75364 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX3O75364 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX3O75364 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PITX3O75364 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX3O75364 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITX3O75364 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX3O75364 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX3O75364 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITX3O75364 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITX3O75364 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITX3O75364 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX3O75364 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX3O75364 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX3O75364 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX3O75364 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX3O75364 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX3O75364 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX3O75364 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX3O75364 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX3O75364 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX3O75364 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX3O75364 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX3O75364 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX3O75364 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX3O75364 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX3O75364 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX3O75364 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX3O75364 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX3O75364 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX3O75364 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX3O75364 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX3O75364 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX3O75364 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX3O75364 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX3O75364 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX3O75364 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX3O75364 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX3O75364 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX3O75364 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX3O75364 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX3O75364 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX3O75364 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX3O75364 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITX3O75364 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITX3O75364 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITX3O75364 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITX3O75364 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PITX3O75364 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX3O75364 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITX3O75364 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 474.5 ms