Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF40O75150 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF40O75150 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF40O75150 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF40O75150 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF40O75150 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF40O75150 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF40O75150 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF40O75150 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF40O75150 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF40O75150 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF40O75150 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF40O75150 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF40O75150 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF40O75150 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF40O75150 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF40O75150 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF40O75150 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF40O75150 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF40O75150 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF40O75150 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF40O75150 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF40O75150 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF40O75150 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF40O75150 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF40O75150 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF40O75150 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF40O75150 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF40O75150 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF40O75150 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF40O75150 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF40O75150 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF40O75150 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF40O75150 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF40O75150 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF40O75150 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF40O75150 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms