Protein–RNA interactions for Protein: O75064

DENND4B, DENN domain-containing protein 4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4BO75064 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.43■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
DENND4BO75064 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
DENND4BO75064 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
DENND4BO75064 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
DENND4BO75064 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
DENND4BO75064 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
DENND4BO75064 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
DENND4BO75064 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
DENND4BO75064 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
DENND4BO75064 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
DENND4BO75064 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
DENND4BO75064 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
DENND4BO75064 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
DENND4BO75064 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.31
DENND4BO75064 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
DENND4BO75064 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DENND4BO75064 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
DENND4BO75064 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
DENND4BO75064 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
DENND4BO75064 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
DENND4BO75064 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
DENND4BO75064 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DENND4BO75064 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
DENND4BO75064 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DENND4BO75064 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
DENND4BO75064 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.59■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
DENND4BO75064 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
DENND4BO75064 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms