Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF10O60809 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF10O60809 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF10O60809 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF10O60809 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF10O60809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF10O60809 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF10O60809 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms