Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSPAN3O60637 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TSPAN3O60637 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSPAN3O60637 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN3O60637 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN3O60637 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN3O60637 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN3O60637 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN3O60637 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN3O60637 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms