Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP8B3O60423 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP8B3O60423 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP8B3O60423 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP8B3O60423 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8B3O60423 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP8B3O60423 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP8B3O60423 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP8B3O60423 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP8B3O60423 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP8B3O60423 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms