Protein–RNA interactions for Protein: O43548

TGM5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM5O43548 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGM5O43548 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TGM5O43548 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TGM5O43548 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TGM5O43548 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGM5O43548 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGM5O43548 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGM5O43548 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGM5O43548 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TGM5O43548 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGM5O43548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGM5O43548 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM5O43548 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM5O43548 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM5O43548 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM5O43548 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGM5O43548 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGM5O43548 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGM5O43548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGM5O43548 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGM5O43548 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGM5O43548 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGM5O43548 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGM5O43548 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGM5O43548 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGM5O43548 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGM5O43548 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGM5O43548 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGM5O43548 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGM5O43548 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGM5O43548 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGM5O43548 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGM5O43548 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGM5O43548 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGM5O43548 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGM5O43548 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGM5O43548 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGM5O43548 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGM5O43548 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGM5O43548 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGM5O43548 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGM5O43548 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGM5O43548 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGM5O43548 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGM5O43548 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGM5O43548 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGM5O43548 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGM5O43548 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TGM5O43548 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TGM5O43548 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGM5O43548 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TGM5O43548 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGM5O43548 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGM5O43548 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TGM5O43548 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TGM5O43548 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGM5O43548 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGM5O43548 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGM5O43548 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGM5O43548 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGM5O43548 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGM5O43548 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGM5O43548 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TGM5O43548 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TGM5O43548 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGM5O43548 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGM5O43548 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGM5O43548 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGM5O43548 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGM5O43548 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGM5O43548 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGM5O43548 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGM5O43548 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGM5O43548 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGM5O43548 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGM5O43548 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGM5O43548 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TGM5O43548 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGM5O43548 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGM5O43548 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGM5O43548 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGM5O43548 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGM5O43548 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGM5O43548 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGM5O43548 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGM5O43548 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGM5O43548 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TGM5O43548 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TGM5O43548 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGM5O43548 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGM5O43548 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TGM5O43548 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGM5O43548 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGM5O43548 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGM5O43548 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms