Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FOXO3O43524 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FOXO3O43524 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FOXO3O43524 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
FOXO3O43524 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FOXO3O43524 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FOXO3O43524 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FOXO3O43524 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FOXO3O43524 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
FOXO3O43524 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
FOXO3O43524 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FOXO3O43524 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FOXO3O43524 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXO3O43524 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXO3O43524 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FOXO3O43524 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms