Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMTOR5O43504 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMTOR5O43504 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMTOR5O43504 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMTOR5O43504 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMTOR5O43504 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMTOR5O43504 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMTOR5O43504 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMTOR5O43504 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMTOR5O43504 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LAMTOR5O43504 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMTOR5O43504 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMTOR5O43504 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR5O43504 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms