Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPA12AO43301 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA12AO43301 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA12AO43301 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA12AO43301 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA12AO43301 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPA12AO43301 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPA12AO43301 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms