Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRXO43186 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRXO43186 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRXO43186 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRXO43186 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRXO43186 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRXO43186 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRXO43186 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRXO43186 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRXO43186 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRXO43186 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRXO43186 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRXO43186 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRXO43186 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRXO43186 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRXO43186 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRXO43186 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRXO43186 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRXO43186 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRXO43186 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRXO43186 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRXO43186 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRXO43186 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRXO43186 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRXO43186 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRXO43186 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRXO43186 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRXO43186 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRXO43186 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRXO43186 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRXO43186 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRXO43186 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRXO43186 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRXO43186 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRXO43186 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRXO43186 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRXO43186 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRXO43186 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRXO43186 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRXO43186 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRXO43186 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRXO43186 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRXO43186 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRXO43186 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRXO43186 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRXO43186 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRXO43186 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRXO43186 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRXO43186 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRXO43186 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRXO43186 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRXO43186 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRXO43186 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRXO43186 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRXO43186 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRXO43186 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRXO43186 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRXO43186 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRXO43186 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRXO43186 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRXO43186 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRXO43186 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRXO43186 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRXO43186 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRXO43186 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRXO43186 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRXO43186 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRXO43186 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRXO43186 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRXO43186 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRXO43186 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRXO43186 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRXO43186 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRXO43186 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRXO43186 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRXO43186 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRXO43186 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRXO43186 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRXO43186 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRXO43186 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRXO43186 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRXO43186 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRXO43186 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRXO43186 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRXO43186 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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