Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFDN6O15212 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFDN6O15212 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PFDN6O15212 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFDN6O15212 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFDN6O15212 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFDN6O15212 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN6O15212 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFDN6O15212 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN6O15212 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFDN6O15212 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms