Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCL22O00626 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCL22O00626 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCL22O00626 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCL22O00626 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCL22O00626 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCL22O00626 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCL22O00626 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCL22O00626 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCL22O00626 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCL22O00626 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCL22O00626 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCL22O00626 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCL22O00626 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCL22O00626 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCL22O00626 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCL22O00626 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL22O00626 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCL22O00626 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL22O00626 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCL22O00626 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL22O00626 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL22O00626 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL22O00626 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL22O00626 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL22O00626 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL22O00626 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCL22O00626 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL22O00626 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL22O00626 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL22O00626 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL22O00626 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL22O00626 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCL22O00626 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL22O00626 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL22O00626 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL22O00626 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL22O00626 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL22O00626 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCL22O00626 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL22O00626 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL22O00626 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL22O00626 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCL22O00626 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL22O00626 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL22O00626 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL22O00626 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL22O00626 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL22O00626 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL22O00626 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL22O00626 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL22O00626 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL22O00626 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL22O00626 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL22O00626 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL22O00626 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL22O00626 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL22O00626 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL22O00626 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL22O00626 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL22O00626 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL22O00626 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL22O00626 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL22O00626 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL22O00626 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL22O00626 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL22O00626 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL22O00626 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL22O00626 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL22O00626 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL22O00626 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL22O00626 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL22O00626 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL22O00626 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL22O00626 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL22O00626 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL22O00626 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL22O00626 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL22O00626 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL22O00626 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL22O00626 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL22O00626 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL22O00626 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL22O00626 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL22O00626 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL22O00626 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL22O00626 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL22O00626 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL22O00626 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL22O00626 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL22O00626 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL22O00626 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL22O00626 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL22O00626 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL22O00626 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms