Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRPO00591 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRPO00591 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRPO00591 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRPO00591 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRPO00591 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRPO00591 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRPO00591 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRPO00591 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRPO00591 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRPO00591 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRPO00591 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRPO00591 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRPO00591 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRPO00591 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRPO00591 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRPO00591 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRPO00591 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABRPO00591 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRPO00591 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRPO00591 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRPO00591 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRPO00591 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRPO00591 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRPO00591 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRPO00591 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRPO00591 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRPO00591 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRPO00591 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRPO00591 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRPO00591 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRPO00591 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRPO00591 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRPO00591 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRPO00591 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRPO00591 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRPO00591 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRPO00591 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRPO00591 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRPO00591 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRPO00591 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRPO00591 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRPO00591 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRPO00591 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRPO00591 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRPO00591 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRPO00591 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRPO00591 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRPO00591 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRPO00591 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRPO00591 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRPO00591 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRPO00591 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRPO00591 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRPO00591 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRPO00591 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRPO00591 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRPO00591 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRPO00591 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRPO00591 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRPO00591 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRPO00591 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRPO00591 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRPO00591 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRPO00591 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRPO00591 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRPO00591 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRPO00591 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRPO00591 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRPO00591 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRPO00591 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRPO00591 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRPO00591 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRPO00591 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRPO00591 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRPO00591 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRPO00591 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRPO00591 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRPO00591 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRPO00591 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRPO00591 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRPO00591 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRPO00591 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms